在第一季结尾中，Jaha自愿留在太空中，换来方舟部分人成功降落到地球上的好消息但百子们却在成功引爆驻地打败地表人后，被抓到气象山的隔离区中……Bellamy和Finn也在与地表人的打斗中生死未卜。　　而这一季的故事就从气象山、原方舟人和其他地球人种展开来。